Produkty bakterií pak zlepšují stav jedince – dodávají například mastné kyseliny střevním buňkám nebo vitaminy, které se vstřebávají. Zpravidla jde o hůře stravitelné typy vlákniny. Prebiotika nepřímo snižují výskyt střevní rakoviny a podle některých údajů mají i sporné imunologické a kostní účinky.
Typickým prebiotikem je polysacharid inulin. Prebiotika obsahuje například kořenová zelenina, čekanka, česnek, cibule a další zeleniny. Potraviny mohou být obohacovány i syntetickými prebiotiky.