COVID-19: otevřené datové sady pro širokou a odbornou veřejnost

Pro veřejnost jsou k dispozici následující datové sady (ke stažení na https://onemocneni-aktualne.mzcr.cz/api/v2/covid-19. Otevřené datové sady jsou dle obsahu seskupeny do několika kategorií: Epidemiologické charakteristiky, Testování, Očkování, Kapacity intenzivní péče a Různé.

Epidemiologické charakteristiky

1. Základní přehled – denní přehledy počtu provedených testů, nových případů, aktivních případů, vyléčených, hospitalizací, úmrtí
2. Přehled osob s prokázanou nákazou dle hlášení KHS – základní denní incidenční přehled osob s prokázanou nákazou dle hlášení KHS (datum hlášení, věk a pohlaví nakažené osoby, KHS, místo a země nákazy)
3. Přehled vyléčených dle hlášení KHS – záznamy o vyléčených osobách dle hlášení KHS
4. Přehled úmrtí dle hlášení KHS – záznamy o úmrtích v souvislosti s onemocněním dle hlášení KHS 
5. Přehled hospitalizací – data hospitalizovaných pacientů popisující průběh hospitalizace (aktuální a celkový počet hospitalizovaných, rozdělení podle příznaků, rozdělení podle podpůrných přístrojů, počet úmrtí) 
6. Celkový (kumulativní) počet osob s prokázanou nákazou dle krajských hygienických stanic včetně laboratoří, počet vyléčených, počet úmrtí a provedených testů - denní počty osob s prokázaným onemocněním COVID-19 dle hlášení krajských hygienických stanic včetně laboratoří
7. Přehled epidemiologické situace dle hlášení krajských hygienických stanic podle okresu – kumulativní denní počty osob s prokázaným onemocněním COVID-19, vyléčených a počty úmrtí dle validovaných hlášení krajských hygienických stanic
8. Přehled epidemiologické situace dle hlášení KHS podle ORP – počty nově diagnostikovaných, aktuálně nakažených, hospitalizovaných osob se zaměřením na seniorní zranitelné skupiny obyvatel (kategorie věku 65+, 75+) na geografické úrovni obcí s rozšířenou působností 
9. Epidemiologická charakteristika obcí – základní epidemiologické parametry (počty nově diagnostikovaných osob s COVID-19, počty aktuálně nakažených) na úrovni obcí ČR  
10. Epidemiologická charakteristika městských částí hlavního města Prahy – na úrovni městských části hlavního města Prahy zahrnuje základní epidemiologické parametry (počty diagnostikovaných osob s COVID-19, počty aktuálně nakažených)  
11. Přehled osob s prokázanou nákazou dle krajských hygienických stanic včetně laboratoří za 7 a 14 dní za ČR – počty potvrzených případů za posledních 7 a 14 dní za celou ČR včetně přepočtu na 100 000 obyvatel  
12. Přehled osob s prokázanou nákazou dle krajských hygienických stanic včetně laboratoří za 7 a 14 dní podle krajů – počty potvrzených případů za posledních 7 a 14 dní za kraje ČR včetně přepočtu na 100 000 obyvatel 
13. Přehled osob s prokázanou nákazou dle krajských hygienických stanic včetně laboratoří za 7 a 14 dní podle okresů – počty potvrzených případů za posledních 7 a 14 dní za okresy ČR včetně přepočtu na 100 000 obyvatel  
14. řehled osob s nově prokázanou nákazou – agregovaná data o nově prokázaných nákazách SARS-CoV-2  
15. Denní přehled testů, prokázaných nákaz, hospitalizací a JIP – agregovaná data v souvislosti s onemocněním COVID-19 
16. Přehled reinfekcí – denní přehled suspektních případů reinfekcí COVID-19 
17. Přehled případů s prodělaným onemocněním – anonymizovaná data o případech infekce onemocnění Covid-19 včetně informací o očkování  
18. Datové sady pro prediktivní modelování –k dispozici jsou po odeslání oficiální žádosti o zpřístupnění následující datové sady: (i) Pozitivita, vyléčení a zemřelí na úrovni okresů; (ii) Časová efektivita testování; (iii) Opakované testování pozitivních pacientů; (iv) Hospitalizovaní pacienti 
19. Protiepidemický systém ČR (PES) - indexy rizika včetně všech hodnot klíčových ukazatelů pro jeho výpočet

Testování 

1. Přehled provedených testů podle typu a indikace – denní počty provedených testů s rozlišením na PCR testy a antigenní testy na onemocnění COVID-19 dle hlášení laboratoří 
2. Celkový (kumulativní) počet provedených testů podle krajů a okresů – přírůstkové a kumulativní denní počty provedených PCR testů s korekcí na opakovaně pozitivní (kontrolní) testy, a to bez rozdílu způsobu úhrady (tedy včetně samoplátců), na COVID 19 za celou ČR podle hlášení laboratoří (rychlotesty nejsou do přehledu zařazeny)  
3. Odběrová místa v ČR – seznam odběrových míst v ČR, kde jsou prováděny PCR a antigenní testy na onemocnění COVID-19  
4. Přehled provedených testů podle krajů ČR – denní počty provedených testů s rozlišením na PCR testy a antigenní testy na onemocnění COVID-19 dle hlášení laboratoří s rozdělením na kraje 

Očkování

V této kategorii lze najít řadu otevřených datových sad o očkování a očkovacích místech, spotřebě a distribuce vakcín, registrací, rezervací, očkování dle profesí, osob s prodělanou nákazou, hospitalizací či úmrtí s ohledem na vykázaná očkování apod. 

Kapacity intenzivní péče

Online dispečink intenzivní péče – volné kapacity – denní přehledy změn volných kapacit v nemocnicích akutní péče (celkové počty dostupných přístrojů, lůžek a personálu společně s volnými kapacitami v jednotlivých dnech)

Různé

1. Distribuce ochranného materiálu – přehled o počtech kusů ochranného materiálu k danému dni, který byl distribuován do jednotlivých krajů v ČR (brýle, dezinfekce, roušky, respirátory, ...)
2. Počet obyvatel podle krajů a okresů v ČR

Související odkazy

1. L. Dušek: Nový Národní zdravotnický informační systém = nová koncepce práce s daty (NZIS Open 2019)
2. L. Dušek: Datová a informační základna pro hodnocení epidemie COVID-19 (NZIS Open 05/2020)
3. M. Komenda: Online reporting a otevřené datové sady o epidemii COVID-19 v ČR (NZIS Open 05/2020)