Očkování, pozitivity, hospitalizace pro COVID-19, úmrtí, long covid a komorbidity u osob v ČR

Datová sada umožňuje hodnotit epidemiologické charakteristiky COVID-19 (incidence, prevalence, mortalita) v populaci České republiky od roku 2020. Uživateli je umožněno údaje stratifikovat dle demografických charakteristik pacientů (pohlaví, věk). Dále lze hodnotit počty pacientů s COVID- 19 léčených v akutní lůžkové péči, včetně detailů o průběhu infekce, symptomech, typech testů, očkování a hospitalizacích. Parametry datové sady zahrnují pořadí infekce, pohlaví, kategorii roku narození, týden detekce nákazy, týden výsledku testu, týden vyléčení, týden úmrtí, symptomy, typ testu, týdny očkování (první až sedmá dávka), druhy očkovacích látek, detaily hospitalizace (včetně JIP, kyslíku, HFNO, UPV/ECMO), a další relevantní údaje jako DCCI index a Long COVID. Datová sada obsahuje také informace o osobách, které do kontaktu s COVID-19 nepřišly. Tyto osoby pak nemají vyplněné datum pozitivity ani očkování proti COVID-19.

V rámci zveřejňování dat z Národního registru hrazených zdravotních služeb (NRHZS) a Informačního systému infekčních nemocí vznikla datová sada přinášející informace průběhu epidemie COVID-19 v České republice ve formě anonymizovaných dat. Datová sada vzniká v souladu s národní metodikou tvorby otevřených dat a je dostupná v národním katalogu.

Jeden záznam (řádek) datové sady obsahuje informaci o jedné osobě a infekci s informacemi o její pozitivitě, hospitalizaci a očkování proti COVID-19. Pokud osoba neprodělala COVID-19 a ani nebyla očkována její řádek obsahuje pouze základní informace jako je pohlaví, kategorie let narození, případné úmrtí a DCCI.

Datová sada je odvozena z dat Národního registru hrazených zdravotních služeb (NRHZS) (parametr DCCI a Long COVID), databáze zemřelých (Datum úmrtí) a Informačního systému infekčních nemocí. Jeden záznam (řádek) hodnotí jednu infekci pacienta. Pro zasazení záznamu do časového kontextu jsou uváděny roky a týdny jednotlivých sledovaných událostí, pokud nastaly. Osoba má v datové sadě tolik záznamů, kolikrát prodělala infekci COVID-19. Pakliže infekci neprodělala ani jednou, je uveden, a právě na jednom řádku.

Z důvodu ochrany osobních údajů fyzických osob je limitována úroveň detailu popisných charakteristik (sada neobsahuje geografickou stratifikaci a rok narození je agregován do rozsahu let).

V NZIS jsou evidované údaje určené explicitně pouze pro účely uvedené v § 70 odst. 1 zákona o zdravotních službách, zejména statistické účely. Nejedná se tedy o referenční údaje ve smyslu § 2 písm. b) zákona č. 111/2009 Sb., o základních registrech, ve znění pozdějších předpisů, které jsou dle § 4 odst. 4 téhož zákona považovány za správné, pokud není prokázán opak nebo pokud nevznikne oprávněná pochybnost o jejich správnosti. ÚZIS ČR neodpovídá za věrohodnost údajů evidovaných v NZIS, ani nemá k dispozici podklady na základě, kterých jsou tyto údaje do NZIS zapisovány a není možné z těchto dostupných údajů dovodit jejich správnost pro účely stanovené jinými právními předpisy.

Ústav zdravotnických informací a statistiky České republiky (ÚZIS) neposkytuje žádné záruky ohledně přesnosti, úplnosti nebo spolehlivosti dat. Jakékoli závěry, analýzy nebo interpretace vycházející z těchto dat jsou výhradní odpovědností uživatele. ÚZIS nenese odpovědnost za žádné škody nebo následky způsobené použitím těchto dat. V případě produkce chybných nebo zavádějících výsledků nemůže být ÚZIS použit jako odkaz či záruka správnosti těchto výsledků.

Na základě této datové sady lze hodnotit epidemiologii COVID-19 v populaci ČR včetně časového vývoje. Kromě absolutních hodnot lze v kombinaci s dalšími datovými zdroji o populaci ČR počítat také standardizované hodnoty – např. přepočet na 100 000 obyvatel, a to souhrnně i s ohledem na pohlaví a věk pacienta.

Typické příklady využití dat:

• Incidenci lze odvodit z počtu záznamů (řádků), kde se hodnocený týden shoduje s týdnem detekce nákazy.

• Prevalenci lze odvodit na základě data pozitivity a vyléčení.

• Lze hodnotit počet osob hospitalizovaných pro COVID-19 v jednotlivých letech dle stavu jejich vakcinace a DCCI

• Příklad konkrétního výstupu:

• Uživatel hodnotí časový vývoj incidence COVID-19 v ČR (počet případů na 100 tisíc obyvatel v roce 2020 vs. v roce 2023), srovnává incidenci v různých věkových skupinách vzhledem k velikosti populace daného věku (tzv. věkově specifická prevalence).

Datová sada byla posouzena z hlediska souladu s následujícími právními předpisy v platném znění:

• Zákon č. 110/2019 Sb., o zpracování osobních údajů,
• Zákon č. 372/2011 Sb., o zdravotních službách a podmínkách jejich poskytování,
• Zákon č. 258/2000 Sb., o ochraně veřejného zdraví,
• Nařízení Evropského parlamentu a Rady (EU) 2016/679 ze dne 27. dubna 2016 o ochraně fyzických osob v souvislosti se zpracováním osobních údajů a o volném pohybu těchto údajů a o zrušení směrnice 95/46/ES,
• Zákon č. 106/1999 Sb., o svobodném přístupu k informacím,
• Směrnice (EU) 2019/1024 o otevřených datech a opakovaném použití informací veřejného sektoru (Směrnice o otevřených datech).

Pro odstranění rizika identifikace fyzických osob jsou data kompletně anonymizována. Časové údaje jsou prezentovány pouze po týdnech (rok), geografické údaje nejsou uváděny vůbec, rok narození pacienta je agregován na pětileté kategorie.

Zdrojem dat pro datovou sadu jsou následující součásti NZIS:

• databáze Národního registru hrazených zdravotních službách (LPZ), dle § 72 odst. 1 písm. g) zákona o zdravotních službách),
• databáze Informačního systému infekční nemoci (ISIN), dle § 72 odst. 1 písm. f) zákona o zdravotních službách,
• databáze Informačního systému List o prohlídce zemřelého (LPZ), dle § 72 odst. 1 písm. h) zákona o zdravotních službách.

Z technického hlediska vzniká tato datová sada kombinací z jednotlivých modulů ISIN (Hospitalizace, Vakcinace, Pozitivity), Informací o úmrtí z databáze LPZ a vybraných parametů (DCCI, Long COVID) z NRHZS.

Detailní záznamy obsažené v datech ISIN byly agregovány a transformovány do podoby, která umožňuje hodnotit epidemii COVID-19 v České republice. Byly k nim následně připojeny data z NRHZS a databáze zemřelých.