primer

Primer je krátká sekvence nukleové kyseliny, která poskytuje výchozí bod pro replikaci DNA (zjednodušeně řečeno „kopírování DNA“):

• V živých organismech jsou primery krátká vlákna RNA. Než může dojít k replikaci DNA, musí být syntetizován (vytvořen) RNA primer, a to enzymem zvaným primáza, což je typ RNA-polymerázy. Syntéza primeru je nezbytná, protože enzymy syntetizující DNA, které se nazývají DNA-polymerázy, mohou připojit nové DNA nukleotidy pouze k již existujícímu řetězci nukleotidů. Primer tedy slouží k primárnímu vytvoření a položení základu pro biosyntézu DNA. Primery jsou odstraněny před dokončením replikace DNA a mezery v sekvenci jsou vyplněny DNA-polymerázami.
• V laboratoři mohou vědci navrhnout a syntetizovat DNA primery se specifickými sekvencemi, které se vážou na sekvence v jednořetězcové molekule DNA. Tyto DNA primery se běžně používají k provádění polymerázové řetězové reakce (PCR).

Obrázek: Primer a jeho funkce při replikaci DNA. DNA primer (tedy primer synteticky připravený v laboratoři) je krátká jednořetězcová sekvence DNA, která se v laboratoři používá například při polymerázové řetězové reakci (PCR). Při této metodě DNA primery (na obrázku vyznačeny oranžově) „dosednou“ na DNA vzorku a tím definují úsek DNA, který má být pomnožen (odborným výrazem amplifikován). Následuje replikace DNA, tj. syntéza nových řetězců DNA, na které se podílí enzym DNA-polymeráza. Tento proces se mnohokrát (20× až 30×) opakuje. Na konci celého procesu je vytvořeno několik milionů až miliard kopií požadovaného úseku DNA (na tomto schématu není zobrazeno). (Zdroj: Upraveno podle National Human Genome Research Institute, Primer)

Viz také oligonukleotid, DNA, RNA.