Pepsin je trávicí enzym, který štěpí proteiny na menší peptidy. Pepsin vzniká z pepsinogenu a je jedním z hlavních trávicích enzymů v lidském trávicím systému, kde pomáhá trávit proteiny přijaté v potravě. Viz také trávicí enzymy.
Pepsinogen je prekurzor pepsinu, tzn. enzymu štěpícího proteiny. Pepsinogen je produkován v buňkách žaludeční sliznice.