Sekvestrace v souvislosti s lékařstvím znamená „abnormální oddělení části od celku“. Prakticky vždy se přitom jedná o nějaký patologický proces.
Příkladem je sekvestrace meziobratlové ploténky, při níž se část dřeňového jádra se zcela oddělila od původní ploténky a nachází se volně v páteřním kanálu; tato oddělená část je někdy označována odborným výrazem sekvestr.
Obrázek: Stadia výhřezu meziobratlové ploténky – schematický nákres. Na čtyřech za sebou následujících schématech v pravé části obrázku (zleva doprava, shora dolů) je znázorněna postupná degenerace meziobratlové ploténky, která může přejít v protruzi, extruzi až sekvestraci. (Zdroj: By Laboratoires Servier, CC BY-SA 3.0, https://commons.wikimedia.org/w/index.php?curid=82641093)
Viz také výhřez meziobratlové ploténky, protruze, extruze, sekvestr.