Patofyziologie má v souvislosti s lékařstvím dva různé významy:
porucha tělesné funkce pozorovaná u určitého onemocnění;
nauka o patologicky změněných tělesných funkcích, jejich vzniku a vývoji.
Odvozené přídavné jméno je patofyziologický.
Viz také patologie, fyziologie.