Mikrotrauma je velmi malé poranění, které většinou není na první pohled vidět. Většinou se jedná o miniaturní trhliny v kosterní svalové tkáni, ve fasciích (obaly kolem svalů) či v pojivové tkáni, včetně šlach a kostí. Většina mikrotraumat způsobuje nízkou úroveň zánětu, který není vidět ani cítit. Mikrotraumata mohou vznikat ve svalech, vazech, kostech (včetně obratlů) i v meziobratlových ploténkách. Opakovaná mikrotraumata, kterým není poskytnut čas na zhojení, mohou vést ke vzniku závažnějších stavů.
Viz také mikro-, trauma.