Eozinofilie má v souvislosti s lékařstvím dva různé významy:
eozinofilie v hematologii – zvýšený počet eozinofilů (určitého typu bílých krvinek) v krvi,
eozinofilie v histologii – vlastnost některých tkání nebo buněk: jsou-li eozinofilní, znamená to, že je lze snadno obarvit eozinem (jedno z mnoha barviv, které se používá při zkoumání tkání a buněk pod mikroskopem).