Embryogeneze je biologický proces, který vede ke vzniku embrya. Začíná oplodněním vajíčka a trvá přibližně 8 týdnů. Embryogeneze se obvykle dělí na dvě fáze:
preembryonální fáze (1.–3. týden po početí) – v tomto období se vyvíjejí tři zárodečné listy; během preembryonální fáze se odehrává blastogeneze, během níž se ze zygoty postupně stává blastocysta;
embryonální fáze v užším slova smyslu (4.–8. týden po početí) – v tomto období se vytvářejí základy orgánových systémů.
Viz také embryo, -geneze.