Artefakt má v souvislosti s lékařstvím dva významy:
V diagnostice – jakékoli zkreslení skutečného stavu, ke kterému může dojít například při zkoumání histologického vzorku pod mikroskopem, vyšetření pacienta nějakou zobrazovací metodou apod. Artefaktem v tomto smyslu může být:
„zobrazená“ struktura, která ve skutečnosti v těle pacienta není;
„chybějící“ struktura, která ve skutečnosti v těle pacienta je;
„nesprávně umístěná“ struktura, která je ve skutečnosti na správném místě;
„nesprávný“ tvar či velikost (ve skutečnosti správné);
apod.
V dermatologii – jakákoli kožní léze, která vznikla nebo je udržována „vlastním přičiněním“ pacienta. Takový artefakt je někdy označován latinským názvem dermatitis artefacta.