Neproteinogenní aminokyseliny jsou všechny aminokyseliny, které nejsou kódovány v DNA, resp. neuplatňují se při proteosyntéze (přirozeném procesu vzniku proteinů v živém organismu, tedy i v lidském těle). U lidí se mezi neproteinogenní aminokyseliny řadí deriváty nebo produkty odbourávání proteinogenních aminokyselin, některé hormony, meziprodukty močovinového cyklu apod. V současné době je známo přibližně 400 neproteinogenních aminokyselin. Konkrétními příklady neproteinogenních aminokyselin jsou citrulin, homocystein, ornitin, taurin či tyroxin.
Viz také neproteinogenní, aminokyseliny, proteinogenní aminokyseliny.